S'inspirant des divers tunnels souterrains et bâtiments techniques du CERN, le Portail de la science du CERN comprendra cinq espaces différents qui accueilleront des expositions, des activités éducatives, des laboratoires permettant de réaliser des expériences pratiques, un grand amphithéâtre, une boutique et un restaurant, et qui seront tous reliés par une passerelle passant au-dessus de la route de Meyrin et de la ligne de tramway qui bordent le laboratoire.
Avec plus de 2 000 mètres carrés de panneaux solaires et entouré d'une forêt de plus de 400 arbres plantés, le Portail de la science laissera une empreinte carbone nulle.